일본으로 일반 입국 시 허용되는 단기비자 90일을 끝까지 채워도 허용 기간을 넘기지 않은 것이라서 출국에 문제가 없고 향후 추가 입국 시에도 아무런 문제가 없습니다.
그리고,
단기비자는 입국일로 90일이 대부분이 허용되지만...그래도 일본 입국 시 받는 사증에 기재된 날짜를 기준으로 체류 기간을 확인하는 것이 가장 정확합니다.
또한, 단기 비자로 체류 시 일본의 어학원을 다니는 것이 문제가 아니지만 일본 현지에서 아르바이트등의 임금을 받는 일을 하면 불법이니 절대 하면 안됩니다.
다만,
출국 시 예상하지 못한 어떠한 문제로 인하여 90일이 되는 날에 출국을 못하면 여러가지로 문제가 될 수 있으니 최소 하루에서 이틀정도는 빠르게 일본에서 출국하는 것이 어떨까 합니다.